中国民族卫生协会是经卫生部、国家民族事务委员会、民政部审核同意并报国务院批准成立的国家一级非营利性行业社会团体。2005年5月18日正式成立，在北京京西宾馆举行了隆重的成立仪式。卫生部为其业务主管单位。
协会以遵守国家宪法、法律和法规，认真贯彻执行党和国家民族卫生政策，团结组织社会各方面力量，加强国内、国际交流与合作，促进民族地区卫生事业发展，弘扬中华民族传统医药，振兴民族医药产业，为各民族地区人民健康服务，为全面建设小康社会、构建社会主义和谐社会服务为发展宗旨。
我国多位杰出的民族领导人担任协会名誉会长：彭冲、白立忱、铁木尔·达瓦买提、阿不来提·阿不都热西提、吴阶平、赵南起、李德洙、钮茂生、刘精松等。全国政协常委、原中央统战部副部长、国家民委主任李德洙同志担任会长，原中纪委、监察部驻医药卫生系统纪检组副组长，卫生部监察局长郁德水同志担任协会常务副会长兼秘书长、法人代表。国家有关部门、各民族地区卫生行业的领导及国内著名专家学者担任协会领导职务或理事。国内医药行业的科研机构、院校、医疗机构及企事业单位和专家、学者、民族人士、卫生战线工作者为协会会员。
目前，协会下属：综合办公室、扶贫项目办公室、培训部、市场调研部、会员管理部、对外联络部。五个分支机构：风湿疑难病专业委员会、民族医药发展专项基金管理委员会、回族卫生专业委员会、健康饮水专业委员会、民族传统疗法专业委员会和民族医药卫生标准专业委员会